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Passo 01

Vá para a página de busca por sequências de nucleotídeos do GenBank aqui http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide.

  1. Clique na opção avançado (Advanced), escolha um táxon (Organism) e um Gene (Gene Name), ou apenas um táxon. Num segundo passo iremos filtrar esses dados para os dados de interesse (isso será feito no R).
  2. Execute a busca!

Iremos baixar os dados no formato FASTA, portanto, veja o que isso significa. Você poderia baixar em outros formatos (GeneBank) que contém informações adicionais, mas FASTA é um formato muito versátil, lido por praticamente todos os softwares de análises filogenéticas e facilmente convertido para outros formatos. Fasta nada mais é do que um arquivo em formato de texto (.txt).

Exporte os TODOS os dados resultantes da sua busca num arquivo no seu computador em formato FASTA.

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  • Última modificação: 22/12/2015 13:12
  • por labotam_admin